Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp6v0e1Q9CQD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp6v0e1Q9CQD8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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