Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9CQC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQC3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms