Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mid1ip1Q9CQ20 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mid1ip1Q9CQ20 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mid1ip1Q9CQ20 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mid1ip1Q9CQ20 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms