Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vgll1Q99NC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vgll1Q99NC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vgll1Q99NC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll1Q99NC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms