Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nkd1Q99MH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nkd1Q99MH6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nkd1Q99MH6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nkd1Q99MH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms