Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epdr1Q99M71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epdr1Q99M71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epdr1Q99M71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epdr1Q99M71 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms