Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q99M08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99M08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99M08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q99M08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q99M08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q99M08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q99M08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99M08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99M08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99M08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99M08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q99M08 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q99M08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99M08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99M08 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99M08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q99M08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99M08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99M08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99M08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99M08 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q99M08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q99M08 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q99M08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q99M08 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q99M08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99M08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99M08 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q99M08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q99M08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99M08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99M08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99M08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q99M08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q99M08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q99M08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q99M08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q99M08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.3 ms