Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smtnl1Q99LM3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smtnl1Q99LM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smtnl1Q99LM3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smtnl1Q99LM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smtnl1Q99LM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms