Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5rap3Q99LM2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdk5rap3Q99LM2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap3Q99LM2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms