Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sh3bp5lQ99LH9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh3bp5lQ99LH9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh3bp5lQ99LH9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sh3bp5lQ99LH9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sh3bp5lQ99LH9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sh3bp5lQ99LH9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms