Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps4Q99KG7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hps4Q99KG7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps4Q99KG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps4Q99KG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hps4Q99KG7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hps4Q99KG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hps4Q99KG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hps4Q99KG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hps4Q99KG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hps4Q99KG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms