Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krcc1Q99JT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krcc1Q99JT5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krcc1Q99JT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krcc1Q99JT5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms