Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ophn1Q99J31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ophn1Q99J31 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ophn1Q99J31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ophn1Q99J31 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ophn1Q99J31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ophn1Q99J31 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ophn1Q99J31 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ophn1Q99J31 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms