Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spdl1Q923A2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spdl1Q923A2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spdl1Q923A2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spdl1Q923A2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms