Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tubb6Q922F4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tubb6Q922F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tubb6Q922F4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tubb6Q922F4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tubb6Q922F4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms