Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZT5

Fgd4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd4Q91ZT5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd4Q91ZT5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fgd4Q91ZT5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fgd4Q91ZT5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fgd4Q91ZT5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Fgd4Q91ZT5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms