Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmco4Q91WU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmco4Q91WU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmco4Q91WU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmco4Q91WU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmco4Q91WU4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms