Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hdac11Q91WA3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac11Q91WA3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac11Q91WA3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms