Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usb1Q91W78 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usb1Q91W78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Usb1Q91W78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usb1Q91W78 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms