Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rprd1aQ8VDS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rprd1aQ8VDS4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rprd1aQ8VDS4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rprd1aQ8VDS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms