Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TgdsQ8VDR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TgdsQ8VDR7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TgdsQ8VDR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TgdsQ8VDR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms