Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q8VDP2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8VDP2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q8VDP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q8VDP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8VDP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8VDP2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q8VDP2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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