Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc8Q8VD72 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc8Q8VD72 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc8Q8VD72 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc8Q8VD72 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc8Q8VD72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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