Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tubg2Q8VCK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tubg2Q8VCK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tubg2Q8VCK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tubg2Q8VCK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tubg2Q8VCK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tubg2Q8VCK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tubg2Q8VCK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubg2Q8VCK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tubg2Q8VCK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms