Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BbxQ8VBW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BbxQ8VBW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BbxQ8VBW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BbxQ8VBW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BbxQ8VBW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms