Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV3

Exosc2, Exosome complex component RRP4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc2Q8VBV3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Exosc2Q8VBV3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Exosc2Q8VBV3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Exosc2Q8VBV3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms