Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top1mtQ8R4U6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Top1mtQ8R4U6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top1mtQ8R4U6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Top1mtQ8R4U6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Top1mtQ8R4U6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
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