Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CipcQ8R0W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CipcQ8R0W1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms