Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casc3Q8K3W3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Casc3Q8K3W3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casc3Q8K3W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms