Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cnot6Q8K3P5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot6Q8K3P5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot6Q8K3P5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot6Q8K3P5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms