Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Phf13Q8K2W6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Phf13Q8K2W6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Phf13Q8K2W6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms