Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtmr3Q8K296 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Mtmr3Q8K296 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtmr3Q8K296 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Mtmr3Q8K296 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Mtmr3Q8K296 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mtmr3Q8K296 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mtmr3Q8K296 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms