Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim68Q8K243 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim68Q8K243 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim68Q8K243 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim68Q8K243 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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