Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkn3Q8K045 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pkn3Q8K045 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pkn3Q8K045 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pkn3Q8K045 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms