Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc87Q8CDL9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc87Q8CDL9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc87Q8CDL9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc87Q8CDL9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms