Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Lin52Q8CD94 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lin52Q8CD94 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lin52Q8CD94 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lin52Q8CD94 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lin52Q8CD94 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms