Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb2Q8CC27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb2Q8CC27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb2Q8CC27 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacnb2Q8CC27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms