Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Samd4aQ8CBY1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Samd4aQ8CBY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samd4aQ8CBY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms