Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ephb1Q8CBF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ephb1Q8CBF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ephb1Q8CBF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms