Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dclre1bQ8C7W7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclre1bQ8C7W7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclre1bQ8C7W7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms