Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc187Q8C5V8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc187Q8C5V8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc187Q8C5V8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc187Q8C5V8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc187Q8C5V8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms