Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN7

Ppm1k, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1kQ8BXN7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppm1kQ8BXN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppm1kQ8BXN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppm1kQ8BXN7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppm1kQ8BXN7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppm1kQ8BXN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppm1kQ8BXN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppm1kQ8BXN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ppm1kQ8BXN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppm1kQ8BXN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms