Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdcl3Q8BVF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Pdcl3Q8BVF2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdcl3Q8BVF2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pdcl3Q8BVF2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.4 ms