Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup54Q8BTS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup54Q8BTS4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup54Q8BTS4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nup54Q8BTS4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms