Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cep55Q8BT07 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep55Q8BT07 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep55Q8BT07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep55Q8BT07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms