Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRN9

Cc2d1b, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d1bQ8BRN9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cc2d1bQ8BRN9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cc2d1bQ8BRN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cc2d1bQ8BRN9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cc2d1bQ8BRN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cc2d1bQ8BRN9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cc2d1bQ8BRN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cc2d1bQ8BRN9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cc2d1bQ8BRN9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.3 ms