Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc4Q8BKW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc4Q8BKW4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zcchc4Q8BKW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms