Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spock3Q8BKV0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spock3Q8BKV0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Spock3Q8BKV0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spock3Q8BKV0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Spock3Q8BKV0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms