Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX0

4933402J07Rik, RIKEN cDNA 4933402J07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402J07RikQ8BHX0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
4933402J07RikQ8BHX0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933402J07RikQ8BHX0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933402J07RikQ8BHX0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933402J07RikQ8BHX0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms