Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GopcQ8BH60 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GopcQ8BH60 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GopcQ8BH60 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms